总结
Affymetrix公司提供的质量控制手段通常有：平均背景噪音（范围20~100）；P所占比重；Poly-A RNA嵌入探针；真核BioB等嵌入探针；actin和GAPDH评估等。
这一节我们详细介绍了如何使用simpleaffy及affyPLM库对基因芯片的质量进行分析。其中包括如何生成质量控制总览图及报告，如何使用FitPLM生成权重，残差及NUSE图像，如何生成RNA降解曲线及MVA线图，如何生成PCA图像 。
经过质量控制的基因芯片数据将进入到表达分析的步骤，其中包括差异表达基因的提取，及GO数据库的联接等，下一节将详细介绍相关内容。
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多谢了 话说您啥时候出bioconductor系列教程之一分析基因芯片下呀~O(∩_∩)O~
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admin 回复:
十二月 8th, 2010 at 6:27 上午
只能说尽快吧。
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joyce 回复:
十二月 9th, 2010 at 8:17 下午
@admin, 多谢~
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admin 回复:
十二月 11th, 2010 at 11:27 下午
@joyce, 不客气。下已经发布了，不过很了草。
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多谢分享，一定认真拜读！
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上面说的MCF7数据我怎么下载不了啊，博主能不能发给我邮箱啊，昨天通宵学习您的博客，中间卡壳了。。
谢谢。。
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admin 回复:
七月 18th, 2011 at 6:08 上午
数据很大，邮箱发送不方便。其实你随便找一组数据就可以了。从我提供的本站链接下载应该可以的。
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