首先升级到最新的firmware,这一步是为了可以使用ssh登录。如果你是第一次登录的话，密码是空的。
qiuworld$ ssh root@192.168.2.2
root@192.168.2.2's password:
Last login: Thu Jan 1 10:08:45 1970 from 192.168.2.3
Linux (none) 2.6.10_mvl401_AG_NAS_3.1.1.exported #1 Thu Sep 6 11:57:38 JST 2007 armv5tejl GNU/Linux
Welcome to MontaVista(R) Linux(R) Professional Edition 4.0.1 (0502020).
root@(none):~#系统时间非常不正确。
root@(none):~# date --set "Wed Jan 18 23:21:21 JST 2012" Wed Jan 18 23:21:21 JST 2012
安装funplug，funplug的作用是安装编译好的软件。因为NAS一般都不带有编译环境，所以使用编译好[......]
1， 出现Error in readRDS(file) : error reading from the connection错误。
出现的原因，安装过程中死机，导致安装不完整。
解决办法，
在Ｒ当中
> .libPaths() [1] "/usr/local/lib64/R/library"
进入/usr/local/lib64/R/library下删除最新安装的所有library。将BiocInsta[......]
Tags: bioconductor
本文心得自：The Split-Apply-Combine Strategy for Data Analysis, Hadley Wickham, Journal of Statistical Software, April 2011, V.40.
引子：
我们常常会遇到这样的问题，数据量很大，并不需要依顺序来依次处理。合理分块处理，并最终整合起来是一个不错的选择。这也就是所谓的Split-Apply-Combine Strategy策略。这在速度上会有比做一个loop有优势，因为它可以并行处理数据。
什么时候我们需要使用到化整为零的策略呢？有以下三种情况：
- 数据需要分组处理
- 数据需要按照每行或者每列来处理
- 数据需要分级处理，和分组很类似，但是分级时需要考虑分级之间的关系。
化整为零策略有点类似于由Google推广的map-reduce策略。当然map-reduce策略的基础是网格，而这里的Split-Apply-Combine的基础完全可以是单机，甚至不支持并行处理的单机都可以。
然而，化整为零并不是一个很直观的编程过程。最直观的过程是使用Loop循环。这里使用一个例子来讲解一下如何实现化整为零策略。在plyr包中有数据ozone,它是一个三维矩阵(24X24X72)，其中最后一维72是指的6年12个月每个月的结果。也就是ozone是一个包括了连续72个月24Ｘ24的三维矩阵数据。三维分别是lat,long,time。我们需要由对时间robust linear model之后的残基residuals。
> library(plyr) # need for dataset ozone > library(MASS) # need for function rlm > month < - ordered(rep(1:12, length=72)) #set time sequence > #try one set > one < - ozone[1,1,] > model < - rlm(one ~ month - 1); model Call: rlm(formula = one ~ month - 1) Converged in 9 iterations Coefficients: month1 month2 month3 month4 month5 month6 month7 month8 month9 month10 month11 month12 264.3964 259.2036 255.0000 252.0052 258.5089 265.3387 274.0000 276.6724 277.0000 285.0000 283.6036 273.1964 Degrees of freedom: 72 total; 60 residual Scale estimate: 4.45 > deseas < - resid(model)
UTF8_E[......]
Tags: bioconductor, 教程, 编程
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